Основой фамилии Духнай послужило мирское имя Духно. Фамилия Духнай происходит от древнего славянского имени Дух, точнее, от его украинской формы — Духно. Таким образом, имя Дух, Духно буквально означало «наделенный душой», «дышащий» (или «живой»). Сейчас фамилия Духнай встречается в основном в Закарпатье. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Духно, со временем получил фамилию Духнай.