Фамилия Дундуев — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с речью и манерой поведения. В говорах «дунду» или «дунда» обозначало человека медлительного, вялого, с ленцой, а иногда — просто молчуна или увальня. Слово это звукоподражательное, передающее тяжелую, неспешную поступь или невнятное бормотание. Так что первый носитель фамилии, скорее всего, получил прозвище Дундуй за свой неторопливый нрав или за манеру говорить сквозь зубы.

Образование фамилии прозрачное: к основе «дундуй» добавили типичный русский патронимический суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — Дундуев). Эта модель одна из самых распространённых в русской ономастике: она закрепилась за фамилиями, произошедшими от прозвищ или имён на -й (сравните: Матвей — Матвеев, Андрей — Андреев, но и Кисляй — Кисляев, Болтуй — Болтуев). Важно, что ударение в фамилии падает на второй слог: Дунду́ев, а не Дундуев, что характерно для южнорусских и украинских говоров, где подобные прозвища были особенно живучи.

Встречается фамилия крайне редко, в основном в Ростовской области и на юге России, что косвенно подтверждает её диалектное происхождение. Других версий, связывающих фамилию с тюркскими или кавказскими корнями (например, с осетинским «дунд» — «холм» или «бугор»), нет — слово «дундуй» в значении «увалень» фиксируется словарями русских народных говоров, и это объяснение гораздо более экономное и правдоподобное.

Если отбросить прозвищную версию, остаётся лишь гипотетическая связь с фамилией Дундуков, которая восходит к балкарскому или карачаевскому имени Дундук (в переводе «толстяк»), но в случае Дундуева суффикс -ев указывает на славянскую, а не на тюркскую модель образования. Так что перед нами чисто русская фамилия, возникшая из живого народного слова, которое сегодня почти забыто.