Фамилия Дьяконенкова — женская форма мужской фамилии Дьяконенков, которая образована по редкой для русских фамилий модели: суффикс -енков, а не стандартное -ов или -ин. Этот суффикс характерен для восточноукраинских и южнорусских говоров (особенно для Курской, Воронежской, Белгородской областей). В отличие от фамилий на -ов, которые означают «сын такого-то», суффикс -енков добавляет дополнительный оттенок уменьшительности или принадлежности к младшему поколению: буквально Дьяконенков — «сын Дьяконка», то есть сын человека, которого звали Дьяконок.

Основа фамилии — отчество или прозвище Дьякон, Дьяконок. В русской традиции прозвище Дьякон давали не только церковнослужителю (дьякону), но и грамотному человеку, певчему в церковном хоре, а иногда и просто бойкому, говорливому человеку — в народе дьякона считали красноречивыми. В документах XVI–XVII веков встречаются крестьяне и посадские люди с прозвищем Дьякон, что говорит о светском, а не обязательно церковном происхождении основы.

Фамилия Дьяконенков — сравнительно редкая. Основной ареал её бытования — юг России (Белгородская, Воронежская области), а также восток Украины. В центральных и северных регионах России более типичны формы Дьяконов или Дьячков (от «дьячок»). Выбор суффикса -енков указывает на то, что предки носителей фамилии, скорее всего, были выходцами из крестьянской или мещанской среды, где такие словообразовательные модели были распространены.

Женская форма Дьяконенкова — это грамматически правильное склонение по тому же принципу, что и у всех фамилий на -ов/-ев: жена или дочь Дьяконенкова. В современных документах и паспортах такая фамилия не склоняется, если принадлежит женщине (в отличие от мужской Дьяконенков). По сути, за фамилией стоит история о предке, которого в деревне звали уменьшительно-ласкательно «Дьяконок» — возможно, за сходство с церковным служителем или за особую манеру говорить.