Фамилия Дюкова — одна из тех, где за простой формой скрывается несколько возможных историй. Самая правдоподобная версия связывает её с прозвищем Дюк. В русских говорах так могли назвать угрюмого, молчаливого человека. Именно от этого прозвища, а не от имени или титула, скорее всего, и пошла фамилия. В пользу этой гипотезы говорят ранние документальные записи: в новгородских и белевских землях XV–XVII веков упоминаются крестьяне Федот Дюка, Дюка Яковлев и Константин Степанов Дюков. Это указывает на то, что прозвище было распространено в крестьянской среде, а не среди знати.

Есть и другие версии, но они менее убедительны. Например, предполагают, что в основе лежит старинное имя Дюк (от латинского «вождь»). Это имя носил былинный богатырь Дюк Степанович, герой киевского цикла. Однако прямых доказательств, что фамилия пошла именно от былинного персонажа, нет. Третья версия — связь с английским словом «duke» (герцог) и гипотеза об обрусевшем иностранце-родоначальнике. Такое объяснение выглядит натянутым: в русской среде прозвище или имя Дюк имело местные корни и не требовало заимствования из другого языка.

Фамилия образована по самой распространённой русской модели: от прозвища или имени на согласный (Дюк) с помощью суффикса -ов, а затем женского окончания -а. Таким образом, Дюкова — это «дочь (или жена) Дюка». Первые носители фамилии, судя по документам, жили на северо-западе Руси, в новгородских землях, где прозвище Дюк фиксируется уже в конце XV века. В отличие от многих «княжеских» фамилий, эта имеет под собой не титул, а бытовое прозвище, что делает её историю более крестьянской и земной.