Фамилия Ефимкин — из числа тех, что образованы напрямую от разговорной формы имени, минуя промежуточные притяжательные прилагательные. В её основе лежит не полное имя Евфимий (от греческого «эуфемос» — благочестивый, священный), а его обиходный вариант Ефимка. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Ефимкин, то есть сын, потомок или человек из семьи Ефимки. Такая модель типична для русских фамилий, возникших в среде крестьян и посадских людей, где полное имя в быту почти не использовали.

Имя Ефим было настолько распространено, что дало целый куст однокоренных фамилий: Ефимов, Ефимкин, Ефимочкин, Ефимычев. Фамилия Ефимкин, в отличие от Ефимовых, встречается реже и имеет более выраженный «простонародный» отпечаток — именно так, через суффикс -к-, в деревнях называли детей и младших членов семьи. Поэтому предки носителей этой фамилии, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками, а не дворянами.

Из известных людей эту фамилию носит российский велогонщик Владимир Ефимкин, что подтверждает её живую бытовую основу, а не книжное происхождение. В написании фамилии важно не путать её с редкой формой Ефимьин — та образована от церковнославянского варианта Евфимий и встречается в среде старообрядцев. Ефимкин же — более поздняя, «обмирщённая» версия, закрепившаяся в XIX веке.