Основой фамилии Екимочкин послужило церковное имя Екимочка. Имя Екимочка - сложившаяся под влиянием «екающего» произношения производная уменьшительная форма мужского крестильного имени Иоаким, которое в переводе с древнееврейского означает «прославленный богом». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Екимочка, со временем получил фамилию Екимочкин.