Фамилия Елкины (и её вариант Ёлкины) происходит от нецерковного имени Елка, Ёлка, которое родители давали ребёнку в дохристианскую и раннехристианскую эпоху. Называя сына или дочь в честь дерева, предки верили, что природа примет младенца как своего и передаст ему силу, выносливость и жизнестойкость ели. С этим же связаны народные поверья: считалось, что дети лесных духов лежат в люльках, подвешенных на елях и соснах, а дети русалок — прямо под елью. Имя Елка должно было защитить ребёнка и сделать его «своим» для окружающего мира.

Словообразовательная модель проста: к основе Елк-/Ёлк- добавлен патронимический суффикс -ин, который в русских фамилиях отвечает на вопрос «чей?» и указывает на прямого предка. То есть Елкин — буквально «сын Елки» или «потомок Елки». Фамилии на -ин типичны для северных и центральных областей России, поэтому географические корни рода, скорее всего, лежат именно там.

Существует и вторая, менее убедительная версия. Согласно ей, Елка — это уменьшительная форма христианских имён Елисей (с древнееврейского — «спасённый Богом»), Елизар («Бог помог»), Елевферий (греч. «свободный») или Елпидифор («несущий надежду»). Однако в пользу «растительной» гипотезы говорит тот факт, что мирские имена от названий деревьев (Дуб, Сосна, Берёза, Ель) были широко распространены на Руси, а вот сокращение крестильных имён до «Елка» встречается редко и документально почти не подтверждено.

Самые ранние упоминания фамилии в исторических источниках приводит С. Б. Веселовский: Александр Андреевич Елка Кобылин, боярин второй половины XVI века; Елка Сергеев, подьячий великого князя (1514 год); Иван Александрович Елкин (1596 год, Белая). Эти записи показывают, что уже в XVI столетии фамилия бытовала и среди служилых людей, и в боярской среде. Потомок человека по имени Елка со временем и получил фамилию Елкин.

Обратите внимание на разницу в написании: Елкин и Ёлкин — это одна и та же фамилия. Буква «ё» в русском языке долгое время была факультативной, и в документах её часто заменяли на «е». Поэтому оба варианта равноправны и указывают на одно происхождение, а путаница в написании не говорит о разных родах.