Фамилия Ениковы (в мужском роде — Еников) относится к числу русских фамилий, образованных от личного имени. Сразу скажем: единого мнения о её происхождении нет, и это как раз тот случай, когда интереснее рассмотреть обе версии.

Первая и наиболее очевидная гипотеза связывает фамилию с церковным именем Евникиан. Это греческое имя, которое переводится как «добропорядочный» или «победоносный». В православном календаре оно закрепилось благодаря памяти одного из десяти мучеников Евникиана Критского. В быту длинное имя сокращали: Евникиан превращался в Еникей, а затем и в простую форму Еник. От неё с помощью типичного русского суффикса -ов и появилась фамилия. Если следовать этой версии, предок Ениковых был крещён именем Евникиан, а в повседневной жизни звался Еником.

Вторая версия выводит фамилию из тюркской среды. Согласно ей, в основе лежит мужское имя Еники, которое бытовало в говоре башкортостанских татар-мишарей. Оно образовано от слова «йани» (или «джани» — «душа моя, душечка») с добавлением уменьшительно-ласкательного аффикса -ки. Такое имя могли дать долгожданному, любимому ребёнку. Эта версия менее популярна в ономастике, но имеет право на существование, особенно если учесть, что фамилии с основой на Еник- встречаются в Поволжье и Приуралье, где веками жили рядом русские и тюркские народы.

Обе гипотезы сходятся в одном: фамилия образована от прозвища или имени Еник, а суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — Еников сын, потомок Еника). Сословная принадлежность первых носителей неясна — фамилия могла возникнуть как в крестьянской, так и в служилой среде. Определить точное место и время её появления сейчас сложно: процесс становления русских фамилий растянулся на несколько столетий. Ясно лишь, что перед нами образец фамилии, в основе которой лежит либо редкое церковное имя, либо столь же редкое тюркское ласкательное прозвище — и в обоих случаях это пример живого взаимодействия языков и культур.