Фамилия Епифаненков относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от крестильного имени Епифаний. Имя Епифаня представляет собой производную форму имени Епифаний. Оно в переводе с греческого языка означает «Богом явленный». В 367 году он был назначен епископом Саламина и управлял Кипрской церковью 36 лет. Таким образом, именование Епифаненко получил «маленький Епифаня», то есть сын Епифани. Фактически фамилия Епифаненков представляет собой отчество второго порядка: Епифаненков - сын Епифаненко и внук Епифани.