Фамилия Епишенков образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Епишенков послужило церковное имя Епифан. Имя Епиша является производной формой канонического мужского имени Епифан (от греческого «epifanes» - «видный, известный, знатный»). Скорее всего, основатель рода Епишенков был человеком из простого сословия. Скорее всего, фамилия Епишенков изначально возникла на территории Украины или Белоруссии, о чем свидетельствует характерный суффикс «-енко». Со временем, вероятно, род Епишенко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса «-ов». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Епиша, со временем получил фамилию Епишенков. О точном месте и времени возникновения фамилии Епишенков в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Епишенков представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.