Фамилия Ернина — женская форма, а мужская, Ернин, встречается реже. В основе лежит либо прозвище, либо крестильное имя, и обе версии ведут к одному корню. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Ернин — сын Ерни. Вопрос в том, кем или чем был этот Ерня.

Самое прямое объяснение — от слова «ерный», которое в русских говорах означало «сердитый», «вспыльчивый», «задиристый». Человека с тяжёлым характером, склочника или сварливого соседа могли прозвать Ерня. Слово «ерный» родственно «ерику» — ссоре, перебранке. Так что предок носителя фамилии мог быть человеком неуживчивым, или же прозвище закрепилось иронично, за спокойным нравом, в пику поведению.

Вторая версия — от производной формы крестильного имени Ермил. В народе его сокращали до Ермилка, Ерма, Ерня. Имя Ермил греческого происхождения, от Гермес — вестник богов. В этом случае фамилия «отчествая»: Ерня — уменьшительное от Ермил, а Ернин — его потомок.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России. Встречается в Архангельской, Вологодской, Кировской областях, а также в Поволжье. Там, где говоры сохранили слово «ерный», прозвищная версия вероятнее. В южных регионах, где это слово не было в ходу, скорее имя Ермил.

Сложность в том, что обе версии сосуществуют, и без точного знания истории конкретной семьи не определить, какая из них верна. Но сам факт, что фамилия редкая и не имеет массового распространения, говорит о том, что её носители, скорее всего, происходят из одного локального рода, а не из разных мест.