Фамилия Ескина образована от имени Еска — уменьшительной формы канонического имени Иосиф. В разговорной речи на Руси это имя чаще звучало как Осип или Есип, а форма Еска возникла как естественное сокращение. Иосиф в переводе с древнееврейского означает «божья награда», и это имя носили многие исторические лица: правители, иерархи, святые мученики и преподобные. Особо почитаем Иосиф-древодел, обручённый муж Девы Марии из рода царя Давида.

Модель образования фамилии проста и типична для русского Севера и центральных областей: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»). Ескин — значит «сын Ески» или «человек из рода Ески». Со временем потомок человека по имени Еска и получил фамилию Ескина.

Интересно, что фамилия Ескина встречается не только у русских. В Поволжье и Приуралье её нередко носили крещёные татары и мордва, где форма Еска также бытовала как адаптация местных имён. Поэтому географическое распространение фамилии шире, чем можно предположить, исходя только из православного имени.

Редкость суффикса -ин в сочетании с основой на -ск примечательна: обычно такие фамилии имеют окончание -ов, но здесь сработала народная традиция склонять уменьшительные имена по принципу «Ваня — Ванин», «Еся — Есин», «Еска — Ескин». Таким образом, фамилия Ескина — живой пример того, как разговорная форма имени закрепилась в официальном родовом прозвании.