Фамилия Еськина образована от уменьшительной формы крестильного имени Иосиф — Еська. Имя Иосиф в переводе с древнееврейского означает «Бог умножит» или «Бог прибавит». В XIII–XVII веках форма Еська была широко распространена на территории современных Винницкой, Житомирской, Киевской, Львовской, Ровенской и Хмельницкой областей — именно там, скорее всего, и жил основатель рода.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Еськина буквально значит «дочь или жена Еськи». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я. В данном случае основа — просторечное Еська, которое возникло в результате усечения и добавления типичного для народной речи суффикса -к-.

Поскольку имя Еська бытовало в основном в крестьянской и рабочей среде, можно с большой долей уверенности предположить, что предки Еськиных не относились к дворянскому сословию. Никаких документальных свидетельств о знатном происхождении этого рода не обнаружено — фамилия типична для непривилегированных слоёв населения.

Интересно, что у фамилии Еськина есть однокоренные «родственники»: Еськов, Еськин, Иосько. Все они восходят к одному источнику — имени Иосиф, но различаются региональными особенностями произношения и суффиксального оформления. Если Еськов — это вариант с типично южнорусским суффиксом -ов, то Еськина закрепилась в северных и центральных говорах.