Фамилия Естифеев — один из вариантов отчества от крестильного имени Евстифий (разговорная форма Евстифей). В русском языке имя Евстифий, в свою очередь, — это народная переработка греческого Евстафий, что означает «устойчивый», «благоустроенный» или «крепко стоящий». Цепочка превращений типична для русской ономастики: сложное греческое имя в быту упрощали, отбрасывали начальное «Ев-» или заменяли звуки, чтобы было удобнее выговаривать. Так появились формы Остафий, Астафий, Стахей, а от Евстифия — фамилии Естифеев, Евстифеев, Остифеев.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Естифеев буквально значит «сын Естифея». Модель образования самая распространённая для русских фамилий из нецерковной и церковной среды, но здесь есть особенность. В отличие от фамилии Евстифеев, где корень сохранил начальное «Ев-», вариант Естифеев отражает более простонародное, «окающее» или «екающее» произношение, при котором первый слог редуцировался. Это не ошибка написания, а живая диалектная черта — так могли записать крестьянина в центральных или южных губерниях, где имя звучало как Естифей.

По социальному составу носители фамилии Естифеев — в основном крестьяне и мещане. В дворянских родословных книгах эта фамилия почти не встречается: родовитые семьи предпочитали более книжные формы вроде Евстафьев или Евстифеев. Зато в переписных книгах XVII–XVIII веков по Рязанской, Тамбовской и Воронежской губерниям Естифеевы попадаются регулярно. Это подтверждает и география: и сегодня фамилия чаще всего встречается в Черноземье и Поволжье.

Любопытная деталь: в некоторых говорах имя Евстифий превращалось в Естихей, откуда пошли фамилии Естихеев и Естихов. Но Естифеев — именно от формы на -фей, а не на -хей. Это видно по суффиксу: если бы исходником было Естихей, фамилия звучала бы как Естихеев. Так что носитель фамилии Естифеев может быть уверен: его предок носил имя, которое в церковном календаре записано как Евстафий, а в быту звался Естифеем.