Фамилия Евстигеев — один из тех случаев, когда привычное уху окончание «-ев» скрывает необычную основу. Вопреки догадкам, корень здесь не связан с «геем» (устаревшее «увеселитель»), а восходит к крестильному имени Евстигней. Это греческое Εὐστύγνιος (Eustýgnios), где εὖ (eu) — «хорошо» и στύγνος (stýgnos) — «печальный, мрачный». Парадоксальное сочетание «благопечальный» или «добропечальный» в древности не смущало — так называли в честь святого Евстигнея Антиохийского, воина-мученика IV века.

Словообразовательная модель типична для XVI–XVII веков: от полной формы имени Евстигней через стяжение отпала середина, и получилось разговорное «Евстигей». Уменьшительное «Евстигейка» или «Евстигей» дало фамилию с патронимическим суффиксом «-ев» — «сын Евстигея». На письме фамилия закрепилась как Евстигеев, хотя в говорах встречается вариант Евстигнеев — более близкий к исходному церковному звучанию.

Интересная деталь: фамилия почти не встречается в центральных губерниях России, зато плотно осела в Поволжье и на Урале. По данным переписей XIX века, больше всего Евстигеевых записано в Саратовской и Самарской губерниях, а также среди казаков Оренбургского войска. Это говорит о том, что носители фамилии — потомки крестьян и однодворцев, переселявшихся на восток в эпоху освоения Заволжья.

Споров о происхождении почти нет: все ономасты (Б. Унбегаун, В. Никонов) сходятся на имени Евстигней. Единственная путаница возникает из-за того, что в метрических книгах фамилию могли записать как Евстигнеев, а в быту произносить как Евстигеев. Так что современный вариант Евстигеев — это не ошибка, а отражение живой народной фонетики, где сложное сочетание «гн» упростилось до «г».