Фамилия Фабрыкин — редкий случай, когда корень слова не славянский, а суффикс — типично русский. Основа «фабрык-» восходит к латинскому «fabrica» (мастерская, ремесло), которое через польский или немецкий языки пришло в русский как «фабрика». В отличие от массовой фамилии Фабрикантов (от «фабрикант» — владелец), Фабрыкин образована по патронимической модели «-ин», то есть изначально это было притяжательное прилагательное: «чей сын?» — Фабрыкин. Значит, отца прозывали Фабрыка.

Кем был этот Фабрыка? Скорее всего, не хозяином производства, а работником — фабричным мастеровым или просто человеком, трудившимся на фабрике. В русских говорах слово «фабрика» имело и переносное значение: так могли назвать суетливого, хлопотливого человека, который «как на фабрике» крутится. Возможен и шутливо-ироничный вариант: Фабрыкой дразнили того, кто пытался казаться важным, «фабричным барином», хотя на деле оставался простым мужиком.

Фамилия почти не встречается в центральных губерниях России, где преобладали Фабрикантовы и Фабричновы. Её ареал — северо-запад и Поволжье, куда фабричное производство пришло позже, а слово «фабрыка» (с твёрдым «ы») могло закрепиться через местные диалекты. В писцовых книгах XVII века подобных прозвищ нет — фамилия сформировалась не раньше середины XVIII столетия, когда в России появились первые мануфактуры.

Примечательна орфография: вариант с «ы» (Фабрыкин, а не Фабрикин) выдает старую традицию написания через «еры» — так слово «фабрика» фиксировали в актах и переписях вплоть до XIX века. В современном языке это выглядит архаично, но для ономастики ценная деталь: фамилия сохранила допетровское произношение.