Фамилия Федюнин происходит от просторечной формы имени Фёдор — Федюня. Так в быту, в кругу семьи или близких людей, называли человека по имени Фёдор, и это ласковое или уменьшительное обращение закрепилось за его потомками как родовое прозвание.

Образование фамилии простое и прозрачное: к основе Федюн- добавили типичный русский притяжательный суффикс -ин. Он отвечает на вопрос «чей?» и указывает на родство: Федюнин буквально означает «сын Федюни», то есть потомок того самого Фёдора. Такая модель широко распространена в русских фамилиях, образованных от имён, оканчивающихся на мягкий согласный или -а/-я: сравните с фамилиями Никитин, Ильин, Кузьмин.

Само имя Фёдор имеет греческие корни и переводится как «дар Божий». Оно было одним из самых частых на Руси, поэтому и производных от него фамилий появилось множество: Фёдоров, Федотов, Федькин, Федяев. Федюнин стоит в этом ряду особняком благодаря редкой основе — имя Федюня встречалось реже, чем стандартные Федя или Федька, что делает фамилию заметной и легко отличимой от однокоренных.

Стоит отметить, что в старину форма Федюня могла бытовать не только как домашнее обращение, но и как самостоятельное нецерковное имя или прозвище. В документах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне и посадские люди с таким именем, и именно от них пошла фамилия. Никакого отдельного смысла, кроме уменьшительно-ласкательного, у слова «Федюня» не было — вся его суть сводится к имени Фёдор.

Несмотря на кажущуюся простоту, фамилия Федюнин несёт в себе отпечаток живой народной речи. Она не возникла в канцеляриях, а выросла из повседневного общения, из того, как звали человека дома, на улице, в своей общине. Поэтому, если вы носите эту фамилию, можно с уверенностью сказать: ваши предки были людьми простыми, но уважаемыми, раз их имя в уменьшительной форме закрепилось за целым родом.