Фамилия Фоняк — редкий случай, когда географический акцент слышен почти сразу. Она явно западноукраинская или польская по модели: суффикс -як типичен для фамилий Западной Украины, Подляшья и юго-восточной Польши. В русской ономастике такой формант почти не встречается, а если и попадается, то как следствие миграции с запада. Так что носитель фамилии Фоняк, скорее всего, имеет корни из Галичины, Волыни или Подкарпатского воеводства.

Основа фамилии — Фоня. Это уменьшительная форма от канонического имени Афанасий (греч. Athanasios — «бессмертный»). В народной речи Афанасий превращался в Фоню, Фаню, Фоньку. В украинском диалектном произношении «ф» могло сохраняться, а суффикс -як добавлял значение «сын» или «человек, связанный с Фоней». То есть Фоняк — буквально «Фонин сын», «потомок Фони».

Есть и вторая, менее вероятная версия: связь с польским словом fon (звук, тон) или диалектным fonić (звучать, гудеть). Тогда прозвище Фоняк мог получить человек с громким голосом или, наоборот, молчун — игра слов. Но эта гипотеза слабее, потому что польские фамилии на -як в основном патронимические, а не от нарицательных слов.

Сословного барьера у фамилии не было. Фоняками могли быть и крестьяне, и мещане, и казаки — суффикс -як не указывает на шляхетство, в отличие от -ский. В документах XIX века фамилия встречается в метриках сёл Львовщины и Тернопольщины, изредка — у переселенцев на Кубани. Письменных упоминаний раньше XVIII века нет: фамилия оформилась поздно, когда в Западной Украине закрепилась модель с -як.

Однокоренные фамилии — Фонякин (русская, с суффиксом -ин), Фонько (украинская, с -ко), польская Foniak. Все они ведут к одному имени-предку, но разошлись по разным регионам и словообразовательным традициям.