Фамилия Габрукова — женская форма фамилии Габруков, и чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с мужским вариантом. В основе фамилии лежит прозвище или имя Габрук, которое, скорее всего, является производным от имени Гавриил. В народной речи это имя часто сокращали до Габрила, Габриха или Габря, а суффикс -ук характерен для западных и южных славянских земель — он указывает на принадлежность: «сын Габрилы» или «маленький Габрила». Таким образом, Габрук — это уменьшительно-патронимическая форма, а Габруков — уже русский вариант, приспособленный под восточнославянскую модель фамилий на -ов.

Есть и вторая версия, менее вероятная, но не лишённая логики: связь с диалектным словом «габрить» — в некоторых говорах так называли говорить невнятно, бормотать. Тогда Габруком могли прозвать неразговорчивого или косноязычного человека. Однако эта гипотеза слабее, так как слово редкое и локальное, а имя Гавриил было повсеместно распространено на Руси, и его производные встречаются в десятках фамилий: Габрилов, Габриков, Габов.

С точки зрения географии, фамилия Габруков тяготеет к южнорусским областям и, возможно, к Беларуси. Суффикс -ук чаще всего встречается именно в белорусской и украинской ономастике, поэтому предки носителей фамилии могли переселиться в центральную Россию с запада. В дореволюционных документах фамилия могла писаться через «о» — Габруковъ, а ударение, скорее всего, падало на второй слог: Габру́ков.

Социальный состав носителей, скорее всего, был крестьянским или мещанским: фамилии на -ук/-юк редко встречаются среди дворянства, так как образованы от простонародных форм имён. Габрукова — фамилия, которая напрямую говорит о родстве: предок был известен в округе как Габрук, то есть «Гаврила-малый» или «Гаврилин сын», и это прозвище закрепилось за его потомками.