Фамилия Ганчурукова — женская форма фамилии Ганчуруков, и в ней интересна не столько основа, сколько модель образования. Мужской вариант заканчивается на -ов, что указывает на принадлежность: буквально «сын Ганчурука». Но сам корень — Ганчурук — не лежит на поверхности. В нём угадывается тюркский след, что для южнорусских и казачьих фамилий дело обычное.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Ганчурук. В тюркских языках есть слово «ганч» (глина, известь) или «гандж» (сокровище, клад), но звучание ближе к диалектному «ганчур» — так в некоторых говорах называли глиняную посуду, черепок или даже неказистый горшок. Суффикс -ук/-юк в украинской и белорусской традиции часто указывает на уменьшительность или принадлежность к чему-то: Ганчурук — это «маленький гончар» либо «сын Гончара». Тогда Ганчуруковы — потомки человека по прозвищу Ганчурук, который мог быть гончаром или просто неряшливым человеком, которого в шутку называли «глиняным».

Менее вероятна, но возможна версия от личного имени Ганча (уменьшительное от Иван через южнославянское влияние), с последующим наращением -рук. Однако для фамилий, оканчивающихся на -ук, типично именно прозвищное происхождение, а не от крестильных имён.

Географически фамилия редкая, её следы ведут в регионы бывшего Дикого Поля — на Северный Кавказ, в Ставрополье, Ростовскую область, где смешивались русские, украинские и тюркские элементы. Встречается она и в Запорожье, что подтверждает связь с казачьей средой. По сословной принадлежности Ганчуруковы, скорее всего, были из крестьян или казаков, а не из дворян, — на это указывает суффикс -ов, а не -ский.

В написании возможна путаница: Ганчурукова или Ганчурякова? Но первая форма устойчивее и встречается в документах XIX века. Если искать родственные фамилии, то рядом стоят Ганчук, Ганчар, Гончарук — все из одного гнезда «глина — горшок — гончар».