Ганя — уменьшительная форма имени Гавриил, которое в переводе с древнееврейского означает «божественный воин». Скорее всего, основатель рода Ганских был человеком из простого сословия. Суффикс -ская может указывать на украинское происхождение фамилии Ганская.