Фамилия Гайдобурова — женская форма фамилии Гайдобуров, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Формант -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: фамилию образовали от прозвища или имени предка по отцу, добавив притяжательный суффикс. В мужском варианте Гайдобуров буквально значит «сын Гайдобура» или «принадлежащий Гайдобуру». Сама основа Гайдобур — редкая и составная, что сразу выделяет фамилию из ряда обычных.

Корень распадается на две части: Гайдо- и -бур. Первая часть, Гайдо, скорее всего, восходит к тюркскому имени или прозвищу Гайда (от тюркского «гайда» — «вперёд», «иди»), которое в русских диалектах могло означать «крикун», «зазывала» или «поводырь». Вторая часть, -бур, менее прозрачна. Она может быть искажением слова «бурый» (по цвету волос или масти скота) или производным от тюркского «бура» — «верблюд-самец», «упрямец». В ономастике известен тюркский антропоним Бура, который в сочетании с Гайда давал прозвище вроде «крикун-упрямец» или «верблюжий погонщик». Таким образом, Гайдобур — сложное прозвище, скорее всего, тюркского происхождения, которое закрепилось за человеком с яркой внешностью или характером.

География фамилии узкая. Основной массив носителей фамилии Гайдобуров сосредоточен в Поволжье, особенно в Самарской и Ульяновской областях, а также в Татарстане. Это неслучайно: регион исторически был зоной активного смешения русского и тюркского населения, где такие гибридные прозвища возникали естественно. Встречаются также единичные случаи в Западной Сибири, куда фамилия могла попасть с переселенцами в XIX веке.

Сословная принадлежность предков Гайдобуровых, скорее всего, была крестьянской или однодворческой. Однодворцы — особая группа государственных крестьян, жившая на южных рубежах России, часто с нерусскими корнями. Фамилия с тюркской основой и русским окончанием типична именно для этой среды. В дворянских родословных книгах Гайдобуровы не значатся, что подтверждает их непривилегированное происхождение.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить этимологию. Например, фамилии Гайдуков, Гайдамаков имеют ту же основу Гайд-, но с разными суффиксами, что указывает на разные пути образования. А вот Гайдобуров уникален именно двусоставной моделью, которая встречается редко и почти не имеет аналогов в русской ономастике. Это делает фамилию ценной для историков языка как пример регионального антропонимического творчества.