Фамилия Гендриксон — это классический пример «патронимической» фамилии, то есть образованной от имени отца. В основе лежит имя Гендрик — одна из производных форм немецкого имени Генрих. Само имя Генрих составное: первая часть восходит к древневерхненемецкому haim (или heim), что значит «дом», а вторая — к rīc, то есть «власть, правитель». Таким образом, имя целиком можно истолковать как «властитель дома» или «хозяин». В Средние века Генрих было одним из самых распространённых имён в Германии, что и объясняет появление множества производных фамилий.

Суффикс «-сон» (от шведского son — «сын») указывает на скандинавскую модель образования фамилий. То есть Гендриксон буквально — «сын Гендрика». Такие фамилии типичны для Швеции, Норвегии и Дании, где они массово закреплялись в XIX веке. В России фамилия Гендриксон могла появиться вместе с переселенцами из Прибалтики или немецкими колонистами, которые жили на Волге и в Петербургской губернии.

Иногда фамилию ошибочно связывают с еврейскими фамилиями немецкого происхождения, вроде Вейценбаум («пшеничное дерево») или Зауэрштром («кислый поток»). Но здесь другой механизм: у евреев Германии часто встречались искусственные фамилии-метафоры, а Гендриксон — прозрачная отчество, без образного подтекста. Так что перед нами типичная скандинавская или, реже, немецкая фамилия, которая попала в русский обиход через Прибалтику и обрусела.