Фамилия Генинова — женская форма от Генинов. Она образована не от имени Геннадий, как может показаться на первый взгляд, а от редкого имени или прозвища Гена. В основе лежит суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — «Генинов сын», то есть сын Гены.

Главная трудность — в происхождении самого имени Гена. Самая вероятная версия: это сокращение от канонического имени Геннадий (греч. «благородный»). В быту уменьшительные формы вроде Гена, Геня, Генаша часто становились самостоятельными прозвищами, от которых и пошли фамилии. Однако есть и другая возможность: в некоторых говорах «гена» могло означать человека с каким-то характерным признаком — например, гнусавого или медлительного (от диалектного «генуть» — тянуть, гнуть). В таком случае фамилия получила бы прозвищное, а не крестильное происхождение.

Географически фамилия Генинова встречается редко, преимущественно в центральных регионах России. Это указывает на то, что она не прошла через массовую фабричную фиксацию в XIX веке, а осталась локальной. Сословно её носители, скорее всего, принадлежали к крестьянам или мещанам: фамилии на -ин типичны для этих слоёв и часто образовывались от имени отца, а не от названия поместья.

Интересная деталь: в дореволюционных метрических книгах можно встретить вариант написания «Гениновъ» с твёрдым знаком на конце, а в некоторых записях — «Генина» (как отчество без фамильного суффикса). Такая нестабильность в написании говорит о том, что фамилия ещё не устоялась в письменной традиции, что тоже характерно для недворянских родов.