Фамилия Гербутова — женская форма от фамилии Гербутов, а та, в свою очередь, образована от прозвища Гербут. Чтобы понять её происхождение, нужно разобраться, что означало это прозвище и в какой среде оно возникло.

Скорее всего, основа прозвища — украинское слово «гербата», то есть «чай». Такая связь даёт сразу несколько возможных занятий предка: он мог быть торговцем чаем, знатоком чайного дела или просто большим любителем этого напитка. Менее очевидная, но тоже правдоподобная версия: Гербутом называли знахаря, который лечил людей травяными настоями и отварами — в народной медицине чаем называли не только привычный напиток, но и любые заваренные травы.

Суффикс -ов- в фамилии Гербутов — стандартный русский патронимический суффикс, указывающий на принадлежность («чей?» — Гербутов, то есть сын или потомок Гербута). Такая модель типична для центральных и северных регионов России. Сама фамилия Гербутова — не самая частая, и её географическое бытование, скорее всего, связано с территориями, где пересекались русское и украинское влияние: южнорусские области, бывшие малороссийские губернии.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Гербутов стоит в одном ряду с более редкими вариантами вроде Гербатовский или Гербут, но без украинского суффикса -енко, который указывал бы на прямое происхождение с Украины. Это говорит о том, что прозвище Гербут закрепилось именно в русской среде, а не было перенесено из украинской фамильной традиции.