Фамилия Гнидкин произошла от прозвища Гнидка. Оно звучит неблагозвучно для современного уха, но за ним стоит одна из двух версий, и обе по-своему логичны.

Первая связывает прозвище с украинским прилагательным «гнiдий» — «темно-рыжий». В русских говорах тоже встречалось слово «гнидой» в значении «гнедой», то есть рыже-бурый масти лошади. Если это так, то прозвище Гнидка указывало на внешность: рыжие или рыжеватые волосы предка. Такие прозвища по цвету волос были распространены повсеместно, и фамилии вроде Рыжов, Чернов, Белов — тому подтверждение.

Вторая версия отталкивается от прямого значения слова «гнида» — яйцо вши. Прозвище с таким неприятным смыслом могло быть охранительным, внутрисемейным оберегом. В народе верили, что если назвать ребенка чем-то плохим, злые силы не позарятся на него и не навредят. Родители, желая сыну здоровья, могли наречь его Гнидкой — и, как ни странно, это считалось добрым пожеланием.

Древнейшее упоминание родственного имени относится к 1500 году: в Новгороде жил крестьянин Иван Гнида. Эта запись из новгородских писцовых книг показывает, что прозвище бытовало уже в XV веке. Суффикс -ин в фамилии Гнидкин указывает на принадлежность: «чей?» — Гнидкин, то есть сын или потомок Гнидки. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я.

Таким образом, Гнидкины — потомки либо рыжего человека, либо того, кого в семье оберегали необычным именем. Обе версии имеют право на существование, и какая из них верна для конкретного рода, теперь уже не узнать.