Фамилия Голёнкин происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Голёнкина образована от топонима Голёнок. Голёнок — это село Конотопского уезда Черниговской губернии, при реке Голенке. Оно было основано в первой половине XVII века, когда принадлежало к числу имений князя Еремея Вишневецкого. Вероятно, основатель рода Голёнкиных был уроженцем этого населенного пункта. Согласно другой версии, фамилия Голёнкин образована от прозвища Голёнка, которое восходит к прилагательному «голый». Таким прозвищем нередко нарекали бедного человека, по какой-либо причине (чаще всего, в случае пожара), лишенного всякого имущества. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Голёнка, со временем получил фамилию Голёнкин. О точном месте и времени возникновения фамилии Голёнкин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Голёнкин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.