Фамилия Голобурдо — это не самостоятельное образование, а фонетический вариант фамилии Голобурда. Разница в окончании возникла из-за окающих говоров: в них безударное «а» после твёрдого согласного звучит как «о», что и закрепилось на письме у части носителей. Поэтому обе фамилии — варианты одного прозвища, и смысл у них общий.

Прозвище Голобурда сложилось из двух слов: «голая» и «бурда». Бурдой в старину называли домашнее пиво — мутное, крепкое, далёкое от современных сортов. «Голой» такую бурду могли назвать либо за отсутствие хмеля (попросту, без добавок), либо за то, что пили её без закуски, «на голую душу». Отсюда и два возможных пути происхождения прозвища: Голобурдой могли прозвать либо самого пивовара, который варил и продавал этот напиток, либо завзятого любителя хмельного, которого иначе как «голой бурдой» и не называли.

Словообразовательная модель здесь редкая и архаичная: сложение прилагательного и существительного в именительном падеже (голая + бурда). Такие прозвища — цельные описательные характеристики человека — типичны для допетровской Руси, когда фамилии ещё не устоялись, а человека метко называли по привычке, ремеслу или внешности. Суффикса -ов/-ев или -ин в фамилии нет, поэтому перед нами пример так называемой «неоформленной» фамилии, которая застыла в форме именительного падежа.

Встречается фамилия Голобурдо и её вариант Голобурда в основном на западе и юге России, а также на Украине — в зоне распространения тех самых окающих и переходных говоров. Точных статистических данных по сословной принадлежности нет, но, судя по прозвищной основе, предки носителей фамилии были скорее всего крестьянами или посадскими людьми, а не дворянами: прозвище слишком бытовое и сниженное для аристократической среды.