Фамилия Головачук образована от прозвища Головач. В основе лежит слово «голова», и здесь сразу возникает несколько версий, что именно оно означало для предка. Самая прямая — прозвище могли дать человеку с крупной, заметной головой или выдающимся умом, «головастому». Но ономастика подсказывает и другой, социальный смысл: «голова» на Руси — это ещё и должность. В разных землях «головами» называли выборных или назначенных руководителей: сельский староста, военный командир, глава стрелецкого приказа. Так что прозвище Головач могло закрепиться за человеком, который занимал такую должность или происходил из семьи «голов».

Суффикс -ук типичен для западноукраинских и белорусских фамилий. Он указывает на сына или ученика: Головачук — буквально «сын Головача» или «малый Головач». Такая модель (основа + -ук/-юк) особенно распространена на Волыни, Подолье, в Галичине и на юго-западе Беларуси. Поэтому фамилия Головачук прочно привязана к этим регионам — в отличие от русской формы Головачёв или польской Головач.

Прозвище Головач со временем заменило наследственное имя в быту и документах, а потом, с введением фамилий, закрепилось за потомками. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще носили великорусские крестьяне и дворяне, фамилии на -ук долго оставались признаком крестьянского или казацкого сословия на территории Речи Посполитой, а затем — в составе Российской империи.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Головачук стоит в одном ряду с Головань, Головатый, Головачёв. Но именно суффикс -ук выделяет её из этого ряда и чётко указывает на западные земли бывшей Киевской Руси, где модель «прозвище отца + -ук» была основной.