Фамилия Головацкая — женская форма фамилии Головацкий. В её основе лежит прозвище Голова, которое в старину давали человеку, отличавшемуся либо необычно большим размером головы, либо выдающимся умом. В словаре С. Б. Веселовского «Ономастикон» упоминается Иван Владимирович Голова Ховрин, боярин великого князя, что подтверждает бытование такого прозвища в среде высшей знати.

Фамилия образована по распространённой восточнославянской модели с суффиксом -цк(ий), который изначально указывал на принадлежность к местности или роду. В данном случае суффикс присоединился к основе Голова-, что характерно для фамилий, возникших в среде польской или украинской шляхты, а также духовенства. Со временем прозвище Голова, закрепившись за родом, полностью вытеснило прежнее родовое имя в быту и документах.

Интересно, что фамилия Головацкий (и её женская форма) встречается преимущественно в западных регионах бывшей Российской империи — на Волыни, Подолье, в Галиции. Это подтверждает версию о её происхождении в среде украинского или польского дворянства. В отличие от более простых фамилий вроде Головин или Голованов, образованных напрямую от прозвища с помощью суффиксов -ин и -ов, вариант с -цк- указывает на более сложную социальную историю носителей.