Фамилия Голубых — типичный пример «северной» модели русских фамилий на -их/-ых. Такая форма указывала на принадлежность целому роду: «из дома Голубых» или «дети Голубых». В отличие от более распространённых фамилий на -ов/-ин, эта модель закрепилась в основном в северных и центральных областях России, а также в Сибири, куда переселенцы принесли свой говор.

Разобраться с основой сложнее: здесь пересекаются как минимум три линии. Первая и самая прямая — от прозвища Голубой по цвету глаз. Вторая — профессиональная: «голубить» означало красить ткани в синий цвет (кубовую краску). Красильщик простых крестьянских холстов, «голубой», получал прозвище по ремеслу. Третья версия отсылает к белорусскому «голуб» — голубь. В этом случае прозвище могли дать за разведение птиц или за внешнее сходство.

В исторических источниках, которые приводит С. Б. Веселовский, родственные прозвища встречаются с XVI века: Голуба Игошина, холопка (1564 г., Суздаль), Евдокия Голуба, холопка (1594 г., Новгород), а также землевладельцы Голубины (1540 г., Тверь). Запись «Голубой кн. Федор Александрович Касаткин-Ростовский» показывает, что прозвище могло носить и знатное лицо.

Самый надёжный след — профессиональный. Прозвище Голубой в значении «красильщик» было распространено, а фамилия на -ых указывает на крестьянскую или посадскую среду, где ремесло переходило по наследству. Версия с голубиной охотой или голубоглазостью тоже возможна, но менее подтверждена источниками. Как бы то ни было, фамилия Голубых закрепилась за потомками человека, которого в своём кругу называли Голубой или Голуб.