Фамилия Гомонкова — женская форма мужской фамилии Гомонков. В основе лежит прозвище или мирское имя Гомонок, которое, в свою очередь, образовано от слова «гомон» — шум, галдёж, нестройный говор многих голосов. В древнерусских диалектах «гомонить» означало «шуметь, кричать, галдеть». Таким образом, Гомонком могли прозвать человека шумного, говорливого, неугомонного, либо того, кто работал в многолюдном месте — например, на торгу или ярмарке, где всегда стоял гомон.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов/-ев присоединялся к основе на согласный (Гомонок → Гомонков), а окончание -а указывает на принадлежность женщине (дочь или жена Гомонкова). Встречается и вариант без суффикса -ок: от прозвища Гомон прямо могла образоваться фамилия Гомонов, но в случае Гомонкова мы видим уменьшительную или пренебрежительную форму — Гомонок, что характерно для северных и центральных русских говоров, где такие суффиксы были особенно активны.

Географически фамилия редкая. По данным открытых источников, наибольшая концентрация носителей — в Вологодской и Архангельской областях, а также в Поволжье. Это косвенно подтверждает диалектную природу основы: слово «гомон» в значении «шум» хорошо сохранилось именно в севернорусских говорах. Встречаются также единичные записи в Беларуси и на Украине, но там фамилия могла возникнуть независимо от той же основы.

С точки зрения социального контекста, фамилия явно недворянская и недуховная. Она относится к разряду так называемых «прозвищных» фамилий, которые в массе своей закрепились за крестьянами и посадскими людьми в XVI–XVII веках. Никаких сведений о знаменитых носителях или исторических событиях, связанных с фамилией, нет — это рядовая, но выразительная фамилия, которая прямо описывает характер предка.