Фамилия Гондарев образована от прозвища Гондарь, которое восходить к диалектному глаголу «гундярить», то есть «говорить в нос, гнусавить». Вероятно, основатель рода Гондаревых говорил невнятно, гнусаво. Чередование гласных о/е объясняется историческими изменениями в языке. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Гондарь, со временем получил фамилию Гондарев.