Фамилия Гонтюрова образована от прозвища Гонтюр, которое связано с украинским словом «гонт» — «кровля; тонко вытесанные деревянные дощечки, которыми настилают крышу, подобно черепице, преимущественно в лесных регионах и Карпатах». Это прозвище, скорее всего, дали человеку, который занимался изготовлением или укладкой гонта — мастера-кровельщика. В лесных районах и Карпатах, где дерево было основным строительным материалом, такой промысел был распространён, и прозвище Гонтюр могло закрепиться за целым родом ремесленников.

Словообразовательная модель здесь проста: к основе Гонтюр- добавился суффикс -ов-, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Гонтюра). Фамилия закрепилась в женской форме Гонтюрова, хотя исходная мужская форма — Гонтюров. Суффикс -ов типичен для русских и украинских фамилий, но основа Гонтюр встречается нечасто, что делает фамилию редкой и географически привязанной к регионам, где гонт был в ходу: западные области Украины, Карпаты, а также приграничные территории России.

В отличие от более распространённых фамилий вроде Гончаров (от «гончар»), Гонтюрова образована от узкопрофессионального термина, который не превратился в повсеместное ремесло. Это говорит о том, что предки носителей фамилии жили в местности, где деревянная кровля была нормой, а не исключением. Альтернативных версий происхождения, например от личного имени, у этой фамилии нет — прозвищная основа Гонтюр прозрачна и не допускает споров. Потомок человека с прозвищем Гонтюр со временем получил фамилию Гонтюрова, которая и сегодня сохраняет память о ремесле, кормившем её первых носителей.