Фамилия Горбаконенко — яркий пример того, как украинская модель словообразования «нанизывается» на русское или общевосточнославянское прозвище. В ней сразу два суффикса, и это главная особенность, которая выделяет её среди множества «Горбуновых» и «Горбачёвых».

Основа — прозвище Горбака. В отличие от «горбатого», которое просто указывает на физический недостаток, «горбака» в говорах могли называть человека с особенно заметным горбом, либо того, кто горбится, сутулится. Но есть и другая версия: в некоторых диалектах «горбакой» называли не только человека, но и животное — например, верблюда или быка с горбом. Прозвище могло закрепиться за пастухом, скотником или просто за человеком, которого сравнивали с таким животным за внешность или повадки.

Далее включается украинский патронимический суффикс -енко, который в XVI–XVII веках был главным способом образовать фамилию со значением «сын такого-то». Горбаконенко — буквально «сын Горбаки». Но почему не «Горбаченко», а именно с «о»? Вставная гласная -о- между корнем и суффиксом — редкий, но встречающийся в украинской ономастике вариант, который усиливает благозвучие и отличает фамилию от более массовых аналогов.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины, особенно к Полтавщине и Черкасщине, где фамилии на -енко особенно распространены. В России она встречается редко и чаще всего как результат миграции украинских крестьян или казаков в XIX–XX веках.

Таким образом, предки носителя фамилии Горбаконенко — скорее всего, казаки или крестьяне из Левобережной Украины. Прозвище Горбака могло относиться к конкретному человеку с заметной внешней особенностью, но со временем, потеряв связь с реальным горбом, фамилия стала просто родовым именем, в котором слышна и украинская языковая традиция, и живая народная наблюдательность.