Фамилия Горковенко — характерный пример украинской модели образования фамилий с суффиксом -енко. В XVII–XVIII веках этот суффикс был главным маркером потомственного именования в Поднепровье и Слобожанщине, обозначая «маленького» или «сына» того, кто назван в основе. То есть Горковенко — буквально «сын Горки» или «потомок Горки».

Само прозвище Горка, от которого образована фамилия, могло возникнуть двумя путями. Первый и самый прямой — топонимический. На Украине десятки сел и хуторов носят названия Гора, Горы, Горки. Переселенец из такого места легко получал прозвище по названию родного села: «откуда родом?» — «с Горки», так и стал Горкой. В условиях, когда фамилии только закреплялись, такой способ был одним из самых распространенных.

Вторая версия — антропонимическая, от имени. В русском и украинском быту имя Георгий дало три основные формы: Георгий, Юрий и Егорий (Егор). Уменьшительное от последнего — Егорка, а в просторечии — Горка. По этой логике Горковенко — потомок человека по имени Горка, то есть Егора. Однако эта версия менее правдоподобна: если бы фамилия пошла от имени, мы бы чаще встречали форму «Егорченко» или «Егоренко». А «Горковенко» с усечением первого слога — случай редкий и нетипичный для украинской ономастики.

Суффикс -енко в фамилии указывает на то, что её носитель происходил, скорее всего, из казацкой или крестьянской среды Левобережной Украины. В этой среде фамилии на -енко в XVII–XVIII веках вытеснили более старые модели на -ович/-евич. Географически фамилия Горковенко и сегодня чаще всего встречается в Черниговской, Полтавской и Сумской областях, что косвенно подтверждает связь с конкретными селами Горки в этих регионах.

Таким образом, наиболее вероятное объяснение: фамилия Горковенко — топонимическая, указывает на предка, который жил в селе с названием Горка или перебрался оттуда. Имя-основа Георгий — лишь отдалённая возможность, не подкреплённая массовостью аналогичных примеров.