Фамилия Горнушкин образована от прозвища Горнушка. Согласно «Толковому словарю» Владимира Даля, «горнушка» — это «жароток в печи», углубление или отверстие в печной кладке, куда сгребают жар. Отсюда первая и самая прямая версия: предок носителя фамилии мог иметь дело с печным делом — клал печи или, возможно, жил в доме, где печь имела характерную конструкцию. Прозвище Горнушка в таком случае закреплялось за человеком по роду занятий или по дому.

Вторая версия связывает основу с украинским прилагательным «гарний» — «красивый, приятный». Это менее вероятно с точки зрения словообразования: украинское «гарний» дало бы скорее фамилию Гарнушкин или Гарний, а не Горнушкин. Однако полностью исключать влияние диалектов и соседних говоров нельзя. Если принять эту гипотезу, прозвище Горнушка могло быть внутрисемейным, ласковым — так родители называли любимого ребёнка, и это имя со временем закрепилось за ним как постоянное.

Суффикс -ин в фамилии Горнушкин указывает на типичную для русских фамилий модель: «чей?» — то есть «сын Горнушки». Форма на -ушк- характерна для уменьшительно-ласкательных прозвищ, что дополнительно поддерживает версию о семейном, неофициальном происхождении исходного имени.

Среди известных носителей фамилии — Юрий Георгиевич Горнушкин, кандидат технических наук, профессор кафедры энергетики Владимирского филиала Московского института электронного машиностроения. Его пример показывает, что фамилия не была привязана к какому-то одному сословию или региону — встречается и в научной среде.

Таким образом, наиболее правдоподобное объяснение фамилии Горнушкин — от прозвища по печному делу или по конструктивной детали печи. Версия с «гарний» остаётся спорной из-за различий в огласовке корня.