Фамилия Грызункова — женская форма от Грызунков, и её разумнее начинать с мужского варианта, чтобы разобраться в корне. Основа здесь — прозвище или некалендарное имя Грызун. В русской ономастике суффикс -ун часто указывает на деятеля: так же образованы говорун, молчун, ворчун. Соответственно, Грызун — человек, который грызёт, то есть либо тот, кто постоянно жуёт (шутливое прозвище любителя погрызть семечки, орехи, сухари), либо, в переносном смысле, въедливый, дотошный, «грызущий» науку или дело. В старину слово «грызть» имело и значение «досаждать, придираться», так что прозвище могло достаться сварливому или очень требовательному человеку.

Суффикс -ов/-ев в фамилии Грызунков — стандартный патронимический, указывающий на принадлежность: «сын Грызуна». Такая модель в XVI–XVII веках была основной для крестьян и посадских людей центральной России. Фамилия довольно редкая, и её география тяготеет к южным и центральным областям: чаще всего Грызунковы встречаются в Воронежской, Курской и Ростовской областях. Это наводит на мысль, что прозвище бытовало именно в среде однодворцев или казачества, где меткие и не всегда лестные уличные имена давали на всю жизнь.

Интересно, что фамилия избежала типичного искажения в «Грызлов» или «Грызунов». Последняя форма (Грызунов) встречается чаще и образована от той же основы, но с другим суффиксом. Грызунков же сохранил более архаичный вариант с уменьшительным или прозвищным суффиксом -ун, что делает его старше по модели. Если Грызунов мог произойти от мирского имени Грызун (встречается в документах XV века), то Грызунков — прямая фамилия от того же имени, но с более поздним патронимическим оформлением. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные образования на -унок, -унков не выделяются отдельно, но логика словообразования здесь прозрачна: суффикс -к- в сочетании с -ов- дал форму, закрепившуюся в фамилиях типа Козунков, Борунков. Так что носитель фамилии Грызункова может с высокой долей вероятности считать своего предка человеком с острым языком или просто большим любителем погрызть что-нибудь вкусное.