Фамилия Губанихина — яркий пример «материнской» фамилии, образованной через суффикс -их-. В русской традиции такие фамилии (Иванихина, Фоминихина, Губанихина) означали «жена Губана» или «вдова Губана». То есть основа здесь — мужское прозвище или неканоническое имя Губан, а суффикс -их- указывает на принадлежность женщине, которая носила это имя по мужу. Позже, когда фамилии закрепились, окончание -а превратило её в женскую форму, а мужской вариант выглядит как Губанихин.

Само прозвище Губан на Руси было распространённым. Чаще всего его давали человеку с большими, толстыми или выдающимися губами — бросавшаяся в глаза черта внешности легко становилась основой для прозвища. Но есть и вторая версия: в некоторых говорах «губан» называли гриб-подосиновик или моховик (из-за бархатистой шляпки, напоминающей губу). Тогда прозвище могло достаться грибнику или тому, кто промышлял сбором и продажей грибов. Обе версии правдоподобны, но первая — внешностная — встречается в антропонимике чаще и проще объясняет появление прозвища у конкретного человека.

Словообразовательная модель на -ихин/-ихина характерна для северных и центральных регионов России, особенно для Вологодской, Архангельской, Костромской областей. Там такие фамилии фиксировались в крестьянской среде, где женщину могли долго называть «Губаниха» — по мужу, а потом это прозвище переходило детям как фамилия. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто давали по отцу, -ихин подчёркивал связь с домом и хозяйством, где главной фигурой могла быть вдова или жена.

Среди однокоренных фамилий — Губанов, Губарев, Губатый. Все они восходят к той же основе «губа», но различаются суффиксами. Губанихина стоит особняком: она не только указывает на конкретный признак, но и сохраняет память о семейном укладе, где женщина становилась «носителем» фамилии через мужа. В современных справочниках фамилия встречается редко, что делает её ценной для локальной истории — скорее всего, предки носителей жили компактно в одном регионе и не рассеивались широко.