Фамилия Губанищев образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Прозвище Губан, скорее всего, получил толстогубый или обидчивый (то есть склонный дуть губы) человек. Суффикс –ищ- в производной форме Губанище, возможно, свидетельствует о крупном, мощном телосложении основателя рода Губанищевых. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Губанище, со временем получил фамилию Губанищев. О точном месте и времени возникновения фамилии Губанищев в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Губанищев представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.