Фамилия Губаньков — одна из тех, что построена по типичной русской модели, но с неочевидным на первый взгляд корнем. На слух она кажется производной от «губа» или «губан», но это лишь вершина айсберга. Разберём словообразовательную цепочку: в основе лежит прозвище Губанько, которое, в свою очередь, образовано от слова «губан» с помощью уменьшительного суффикса -к-. Суффикс -ов в конце фамилии — стандартный патронимический показатель, указывающий на принадлежность: «чей?» — Губаньков, то есть сын или потомок Губанько.

Ключевой вопрос — что означало прозвище Губан? Здесь есть две основные версии, и обе имеют право на жизнь. Первая и самая прямая: от слова «губа» в значении «рот». Губаном на Руси называли человека с большими, толстыми или отвислыми губами. Такие прозвища по внешним признакам были очень распространены и не несли обязательной оскорбительности — скорее, служили меткой приметой. Вторая версия, менее очевидная, но не менее интересная: «губан» могло быть диалектным названием гриба, чаще всего подберёзовика или волнушки. В некоторых говорах «губами» называли грибы вообще. Тогда прозвище Губан мог получить грибник, торговец грибами или просто человек с соответствующей фамильной чертой.

Примечательно, что фамилия Губаньков встречается в основном в центральных и южнорусских регионах, с заметной концентрацией на территории бывшей Орловской губернии и в прилегающих областях. Это косвенно подтверждает, что основа могла быть именно диалектной — в южновеликорусских говорах слово «губан» в значении «гриб» фиксируется словарями. Украинский суффикс -к- в прозвище Губанько тоже не случаен: он указывает на возможное малороссийское происхождение предка или на длительное проживание в пограничной зоне, где смешивались русские и украинские говоры. Таким образом, фамилия могла возникнуть на стыке двух языковых стихий.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Губанов, Губарев, Губкин — показывает, что Губаньков стоит особняком. Если Губанов образовано напрямую от «губан» без уменьшительного суффикса, а Губарев — от профессии (губарь, ловец губок или, в другом значении, работник на соляных промыслах), то Губаньков несёт в себе отчётливый оттенок ласкательности или уменьшительности. Это могло означать, что прозвище дали не взрослому мужчине, а, скажем, подростку или младшему в семье, которого в отличие от отца звали не просто Губан, а ласково Губанько. Со временем это прозвище закрепилось за родом и превратилось в фамилию.