Фамилия Губанцев — наглядный пример того, как русская модель словообразования превращает простое прозвище в фамилию с четкой географической привязкой. Основа здесь — «губан», прозвище человека с большими или толстыми губами. В старину такие прозвища давали без обидного оттенка, просто по внешней примете, как Губа, Губан, Губастый. Суффикс «-ев» указывает на принадлежность: Губанцев буквально означает «сын или потомок Губанца». Но ключевая деталь — суффикс «-ц-» (Губанец). Он типичен для жителей определенной местности или выходцев из села: Губанец — это «человек из Губани» или просто «тот, кого звали Губан», но с уменьшительно-притяжательным оттенком.

В отличие от более распространенной фамилии Губанов, где суффикс «-ов» просто обозначает «сын Губана», Губанцев несет отпечаток северных и северо-западных говоров. Суффикс «-ец» характерен для ойконимических фамилий (по названию деревни), и можно предположить, что предок носителя фамилии был выходцем из населенного пункта вроде Губани или Губанцево. Такие названия встречаются в Вологодской, Архангельской областях и в Поволжье. Однако прозвищное происхождение не менее вероятно: в документах XVI–XVII веков встречаются крестьяне с именем Губанец — так могли назвать не только за губы, но и за манеру говорить (губастый — говорливый).

Сословный состав фамилии типичен для крестьянской и мещанской среды. В переписях XVIII–XIX веков Губанцевы фиксируются в основном как государственные крестьяне и однодворцы в центральных губерниях (Тамбовская, Рязанская, Пензенская). Редкость фамилии (по данным современных справочников, ее носит менее тысячи человек в России) объясняется именно локальным характером прозвища и суффиксальной модели. В ономастике фамилия Губанцев стоит в одном ряду с однокоренными Губанов, Губарев, Губатый, но отличается от них именно этим «-ц-», который указывает на более узкое, возможно, деревенское происхождение.