Фамилия Гундарцев — наглядный пример того, как географическое название превращается в родовое имя. Её основа — топоним Гундари, Гундары или похожий. Такие названия встречаются в южнорусских и украинских землях, чаще всего в бывшей Области Войска Донского и на Кубани. Скорее всего, предок носителя фамилии был выходцем из населённого пункта с подобным именем, и его прозвали «гундарским», то есть «тем, кто из Гундарей». Суффикс -цев — типичный для русских фамилий, образованных от названий мест на -арь, -ерь, -ырь. Он указывает на принадлежность: «чей?» — «гундарцев», то есть сын или потомок человека, связанного с Гундарями.

Сам топоним Гундари может иметь тюркские корни. В тюркских языках «гун» или «кун» — солнце, день, а «дар» — место, долина. Вполне возможно, что название означало «солнечное место» или «южная сторона». Есть и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным словом «гундарый» — гнусавый, картавый. Но для фамилии с суффиксом -цев такая основа маловероятна, потому что прозвища по физическим недостаткам обычно давали в форме Гундарь, откуда пошла бы фамилия Гундарев, а не Гундарцев.

В документах фамилия встречается с XVIII–XIX веков, преимущественно в казачьих областях. Гундарцевы были людьми служилыми: казаками, урядниками, иногда мещанами. Фамилия не слишком распространена, её ядро — Ростовская область, Краснодарский край, Ставрополье. Встречается также у потомков донских и кубанских казаков, переселившихся в Сибирь и на Дальний Восток в ходе аграрных реформ.

Интересная деталь: в старых метрических книгах фамилию иногда писали через «о» — Гондарцев. Это не ошибка, а отражение акающего произношения, свойственного южнорусским говорам. Такое написание — дополнительная подсказка, что корни фамилии именно с юга России.