Фамилию Гурковы чаще всего выводят из разговорной формы крестильного имени Гурий. Полное имя Гурий в переводе с древнееврейского означает «львёнок», а в быту его сокращали до Гурок — ласково-уменьшительного варианта. По этой версии, предок Гурковых был Гурком, то есть сыном или внуком человека по имени Гурий. Такая модель образования — усечение имени и добавление суффикса -ов — типична для русских фамилий XVI–XVII веков.

Однако есть и другая, не менее интересная версия. В украинском языке «гура» значит «куча», а в переносном смысле так могли назвать человека надоедливого, докучливого или, наоборот, скупого. Кроме того, слово «гуральня» (винокурня) даёт ещё один вариант: прозвище Гурок могли дать винокуру. То есть фамилия могла закрепиться за человеком по роду занятий, а не по имени.

Форма Гурковы указывает на множественное число или на принадлежность к целому роду. Такое окончание чаще встречается в северных и сибирских говорах, где фамилии на -овы, -евы нередко произносили и писали с ударением на последний слог. В официальных документах XIX века фамилия фиксировалась и в единственном числе — Гурков, но в быту и устной традиции сохранилась форма множественного числа, подчёркивающая семейную общность.

Споров о происхождении фамилии меньше, чем кажется: имя Гурий было распространено у русских, украинцев и белорусов, а прозвищные версии (от «гура» или «гуральня») привязаны к украинской языковой среде. Поэтому если род Гурковых связан с южнорусскими или украинскими землями, вторая версия становится правдоподобнее. Точное место и время возникновения фамилии установить сложно — процесс формирования фамилий длился несколько столетий, и Гурковы могли появиться независимо в разных регионах.