Фамилия Гурненко — яркий пример украинской модели фамилии, образованной с помощью патронимического суффикса -енко. В украинской ономастике суффикс -енко исторически означал «сын» или «потомок», то есть Гурненко — буквально «сын Гурны» или «потомок Гурны». Встречается эта фамилия преимущественно в центральных и восточных областях Украины, а также в прилегающих районах России, куда переселялись украинцы.

Основа фамилии — имя или прозвище Гурна. Скорее всего, это народная, разговорная форма от канонического имени Гурий (в крестьянской среде имя часто усекали: Гур, Гура, Гурка). Гурий — имя греческого происхождения, означающее «львёнок» или «молодой лев». В этом случае Гурненко — типичный пример того, как церковное имя в быту превратилось в прозвище, а затем в фамилию.

Есть и другая, менее вероятная версия: от прозвища Гурна, связанного с глаголом «гурчать» (ворчать, бурчать) или с диалектным «гурна» — так в некоторых говорах называли глиняный кувшин или горшок. Тогда прозвище могло относиться к гончару или к человеку с ворчливым нравом. Однако первая версия — с именем Гурий — встречается в ономастических справочниках чаще и считается основной.

Интересная деталь: в отличие от более массовых фамилий на -енко (Шевченко, Коваленко), Гурненко — довольно редкая. Она не попала в число распространённых дворянских или казацких фамилий, что говорит о её крестьянском или мещанском происхождении. Носители фамилии, скорее всего, были простыми людьми: земледельцами, ремесленниками или мелкими торговцами.

В написании фамилии встречается вариант Гурненко (с твердым «н»), что характерно для южнорусских и украинских говоров. В России фамилия могла немного видоизменяться под влиянием местной фонетики, но основной костяк — именно украинский.