Фамилия Игнатченков образована от мужского крестильного имени Игнатий, которое в переводе с латинского означает «огненный» (по другой версии — «неведомый»). В основу фамилии легла не сама полная форма имени, а его производная, разговорная форма — Игнатча. Такое стяжение характерно для народной речи: Игнатий превращался в Игната, а затем в Игнатчу — ласковый или обиходный вариант, который и стал основой для фамилии.

Суффикс -енков указывает на модель образования, типичную для восточноукраинских и южнорусских земель. В этой модели суффикс -енко (позже адаптированный в русском варианте как -енков) обозначал «сына» или «потомка». То есть Игнатченков буквально означает «сын Игнатчи» или «потомок Игнатчи». Со временем, при переходе на великорусскую почву, украинское окончание -енко обросло типичным русским суффиксом -ов, что и дало современное звучание Игнатченков.

Фамилия относится к группе так называемых патронимических фамилий — то есть образованных от имени отца или деда. Предок носителя этой фамилии, скорее всего, был простым человеком: в крестьянской и казачьей среде такие «полуимена» (Игнатча, Игнатка) были нормой, а полное церковное имя Игнатий использовалось реже. Таким образом, фамилия Игнатченков — не редкий случай, а часть обширного гнезда однокоренных фамилий: Игнатов, Игнатченко, Игнатьев, Игнатенков.

С географической точки зрения фамилия тяготеет к югу России и востоку Украины — регионам, где активно работала модель на -енко. Если искать корни, то наиболее вероятны современные Белгородская, Воронежская, Ростовская области или бывшая Слобожанщина.