Фамилия Иконников ведет происхождение от прозвища Иконник. В словаре Владимира Даля «иконником» называли того, кто пишет иконы или торгует ими. Это был не просто ремесленник, а человек, связанный с сакральным искусством, потому прозвище было уважаемым и распространенным. От него по самой частотной модели — с суффиксом -ов, обозначавшим принадлежность («сын Иконника»), — и возникла фамилия.

О точном времени и месте её появления говорить сложно: фамилии в разных слоях общества закреплялись на протяжении нескольких столетий, с XV по XIX век. Однако можно уверенно сказать, что корень у фамилии не кабинетный и не книжный, а живой, ремесленный. В некоторых говорах слово «иконник» имело и более широкий смысл — «богомаз», то есть создатель образов, а в переносном значении порой даже «набожный человек». Поэтому не исключено, что прозвище могли дать не только мастеру, но и человеку, ревностно соблюдавшему обряды.

Самый известный носитель фамилии — Владимир Степанович Иконников (1841–1923), русский историк, академик Петербургской АН. Он посвятил себя изучению русской историографии: написал монографию «Скептическая школа в русской историографии и её противники» (1871) и фундаментальный «Опыт русской историографии». Ему же принадлежат статьи о Н. Карамзине, К. Бестужеве-Рюмине, Л. Шлецере, И. Болтине. Выходец из духовного сословия, он в своей научной работе как бы вернулся к истокам собственной фамилии — к миру книжной и иконописной культуры.

С точки зрения словообразования фамилия Иконников прозрачна: основа «иконник» + патронимический суффикс -ов. Это типичная «профессиональная» фамилия, каких много в русском ономастиконе (Золотарев, Серебряников, Пономарев). Но в отличие от, скажем, Кузнецова, она несет отпечаток не просто ремесла, а церковного искусства, что выделяет её на фоне однокоренных.