Фамилия Инковы — редкий случай, когда сразу видно, что её основа не полное имя, а прозвище или, скорее всего, краткая форма крестильного имени. Судя по суффиксу -ов, перед нами типичная русская патронимическая (отцовская) фамилия, но с необычным корнем.

Самая вероятная версия: фамилия образована от просторечной или бытовой формы имени Иннокентий. В русской народной традиции длинные церковные имена часто усекали до одного-двух слогов: Иннокентий превращался в Иня или Ина. От этих форм и пошли фамилии Инин, Инютин, а также Инков (через добавление суффикса -к-, который давал значение «маленький» или «сын»: Ин(а) + к + ов = сын Ины). Так что предок Инковых, скорее всего, звался Иня — то есть Иннокентий, только по-домашнему.

Есть и другая, менее распространённая гипотеза, которую иногда приводят в региональных ономастических заметках. В некоторых говорах «инка» или «инок» — это не монах, а прозвище человека, который живёт уединённо, нелюдим или просто сторонится людей. Однако для этой версии мало прямых письменных подтверждений в словарях древнерусских прозвищ. Версия с Иннокентием надёжнее, потому что модель «усечённое имя + -к + -ов» — одна из самых продуктивных в русской фамильной системе XVI–XVII веков.

Географически фамилия Инковы встречается нечасто. Основной ареал — центральные области России (Владимирская, Нижегородская, Костромская губернии) и Поволжье. Встречается она и у староверов, что косвенно подтверждает версию о церковном имени: Иннокентий было популярно в среде старообрядцев, которые часто давали детям редкие святцевые имена, а потом сокращали их до неузнаваемости.

С точки зрения словообразования фамилия Инковы интересна тем, что её основа — Инк- — может показаться иноязычной или заимствованной, но на самом деле это чисто русский продукт усечения. В этом её отличие от похожих на слух фамилий Инберг или Иноземцев: здесь нет ни географического, ни этнического корня, только бытовая переделка имени.