Фамилия Ионкина образована от производной формы мужского крестильного имени Иона. С древнееврейского языка это имя переводится как «голубь». В основу фамилии легла уменьшительная форма — Ионка. Так в быту называли человека, носившего полное церковное имя Иона. Фамильный суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Ионки» или «внук Ионки». Со временем потомки человека по прозвищу Ионка закрепили за собой фамилию Ионкина.

В русской ономастике фамилии на -ин чаще всего образовывались от основ, заканчивающихся на -а или -я. Здесь основа Ионк- как раз подпадает под эту модель, что делает фамилию типичной для северных и центральных регионов России, где такие формы особенно распространены. Примечательно, что имя Иона в православных святцах встречается нечасто, поэтому фамилия Ионкина сравнительно редкая — она сосредоточена в основном в Поволжье и некоторых областях Центральной России.

Встречается также вариант с ударением на второй слог — Ио́нкина, что отличает её от более частых фамилий с ударным окончанием. Если ваш предок носил эту фамилию, скорее всего, он происходил из крестьянской или мещанской среды, где уменьшительные имена были обычным делом. В дореволюционных метрических книгах фамилия могла записываться через «и» с одной «н» — Ионина, но форма Ионкина устойчиво сохраняет суффикс -к-, указывающий на конкретное прозвище.

Таким образом, фамилия Ионкина — не просто калька с библейского имени, а живое свидетельство того, как в русской деревне церковное имя перерабатывали в бытовое прозвище, которое затем становилось родовым.