Фамилия Иовенко образована по одной из самых распространённых в украинской ономастике моделей — с помощью суффикса -енко. Этот суффикс, изначально указывавший на родство по отцу, буквально означал «сын» или «потомок» (малый, молодой). Со временем он закрепился как фамильный и стал массово оформлять фамилии на территории Левобережной и Степной Украины, особенно в среде казачества и крестьянства. Таким образом, Иовенко — это «сын Иова».

В основе фамилии лежит мужское крестильное имя Иов, которое пришло в русскую и украинскую традицию из библейского текста. Ветхозаветный Иов известен как образец терпения и праведности. Имя это никогда не было частым, поэтому фамилия Иовенко встречается заметно реже, чем, скажем, Иванов или Петров. С точки зрения словообразования интересно, что в основе лежит полная, а не уменьшительная форма имени, что указывает на прямое именование по отцу без промежуточных прозвищ.

При разборе фамилии стоит обратить внимание на начальное «Ио-». В церковнославянской и старой книжной традиции такое написание было нормой, но в бытовой речи имя нередко произносили и записывали как «Иов» с одним звуком. В украинской среде возможны были варианты с заменой корня, например, от просторечной формы «Ив» или «Ивась», но фамилия Иовенко сохранила именно архаичную, книжную огласовку. Это говорит о том, что предок носителя фамилии, скорее всего, был грамотным человеком или получил имя по церковной записи, без упрощений.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины, где суффикс -енко был основным способом образования фамилий. Встречается она и в России, куда попала вместе с миграцией украинского населения в XVII–XIX веках, особенно на Кубань и в южные губернии. Сословной привязки у фамилии нет: Иовенко могли быть и казаками, и крестьянами, и мещанами.